En el territorio municipal existen varias zonas con vestigios prehispánicos, entre los que se encuentra la zona arqueológica de Acozac, donde destaca un basamento piramidal redondo dedicado a Ehecatl Quetzalcoatl y un juego de pelota los cuales fueron parcialmente destruidos y se realizaban actos ceremoniales como el sacrificio. Tlapacoya con su centro ceremonial, donde ademas se descubrió un templo prehispánico el cual según investigaciones científicas se encontraron las mas antiguas evidencias de la presencia del hombre en el territorio mexicano; se destaca entre los más importantes de Mesoamérica, Tlalpizahuac cuyo rescate arqueológico se realizó en 1987, el sitio se ubica cronológicamente en los denominados segundo intermedio, fase I 750-900 D.C. y fase II, 950-1150 D.C.
En este territorio se encuentra en el centro de Ixtapaluca la parroquia de Señor de los Milagros (San Jacinto), Ayotla (parroquia del Rosario), Coatepec (Parroquia de San Isidro Labrador o del Rosario), etc.
